Бактериофаг коли протеиновый: Колипротейный бактериофаг, инструкция по применению, цена, противопоказания и состав

Книги Журналы

Новости

30 января 2023

Компания группы ИСКЧ стала резидентом кластера «Ломоносов»

Для резидентов будет создан максимально благоприятный режим налогообложения и регулирования.

Подробнее

30 января 2023

Перчатки за 1 доллар США могут помочь предотвратить осложнения при родах

30 января 2023

Европа может заплатить больше за меньшее количество противоковидной вакцины Pfizer

/upload/iblock/8ef/bakteriofagi%2520tab%25203.pdf

Врачам

30 января 2023

Вторая линия лекарственной терапии билиарного рака

И.В. Савченко^1,2*, В.В. Бредер¹, И.С. Стилиди^1,2, К.К. Лактионов^1,2, Н. Е. Кудашкин^1,2…

Подробнее

27 января 2023

Синус-лифтинг в стоматологии и его значение при имплантации зубов

26 января 2023

COVID-19-ассоциированная флебопатия как актуальная проблема современной флебологии

Фармацевтам

25 января 2023

Замена упаковки препарата из-за проблем с кодом в системе «Честный знак»

Покупательница приобрела препарат и тут же, проверив его с помощью мобильного приложения «…

Подробнее

16 января 2023

Трудовое законодательство: что нового?

19 декабря 2022

Лекция: Современная аптека.

Искать

Раздел не найден.

Раздел не найден.

Сеть белковых взаимодействий бактериофага Lambda с его хозяином, Escherichia coli

1. Lederberg E. 1951. Лизогенность Escherichia coli K-12. Генетика 36:560 [Google Scholar]

2. Раджагопала С.В., Касженс С., Уетц П. 2011. Карта взаимодействия белков бактериофага лямбда. БМС микробиол. 11:213. 10.1186/1471-2180-11-213 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

3. Hendrix R, Casjens S. 2006. Бактериофаг лямбда и его генетическое окружение, стр. 409–445 В Календарь Р. (ред.), Бактериофаги. Oxford University Press, Оксфорд, Англия [Google Scholar]

4. Court DL, Oppenheim AB, Adhya SL. 2007. Новый взгляд на генетические сети бактериофагов лямбда.

5. Cao Y, Lu HM, Liang J. 2010. Вероятностный ландшафт наследуемого и надежного эпигенетического состояния лизогении у фага лямбда. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 107:18445–18450 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

6. Цай Дж.М., Сиппи Дж., Фейсс М., Смит Д.Э. 2009. Мотив Q. вирусного мотора упаковки управляет его генерацией силы и связывает распознавание АТФ с взаимодействием ДНК. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 106:14355–14360 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

7. Rajagopala SV, Yamamoto N, Zweifel AE, Nakamichi T, Huang HK, Mendez-Rios JD, Franca-Koh J, Boorgula MP, Fujita К, Судзуки К, Ху Дж.С., Ваннер Б.Л., Мори Х., Уэтц П. 2010. Escherichia coli K-12 ORFeome: ресурс для сравнительной молекулярной микробиологии. Геномика BMC 11:470. 10.1186/1471-2164-11-470 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

8. Раджагопала С.В., Уэтц П. 2009. Анализ белок-белковых взаимодействий с использованием двухгибридных экранов на основе дрожжей. Методы Мол. биол. 548:223–245 [PubMed] [Google Scholar]

9. Rajagopala SV, Hughes KT, Uetz P. 2009. Сравнительный анализ двухгибридных систем дрожжей с использованием взаимодействий белков подвижности бактерий. протеомика 9:5296–5302 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

10. Chen YC, Rajagopala SV, Stellberger T, Uetz P. 2010. Исчерпывающий бенчмаркинг двухгибридной системы дрожжей. Нац. Методы 7:667–668 [PubMed] [Google Scholar]

11. Сальгадо Х., Перальта-Хил М., Гама-Кастро С., Сантос-Завалета А., Мунис-Раскадо Л., Гарсия-Сотело Х.С., Вайс В., Солано-Лира Х., Мартинес-Флорес И., Медина-Ривера А., Сальгадо-Осорио Г., Алькисира-Эрнандес С., Алькисира-Эрнандес К., Лопес-Фуэнтес А., Поррон-Сотело Л., Уэрта А.М., Бонавидес-Мартинес К., Бальдерас-Мартинес Ю.И., Паннье Л., Ольвера М., Лабастида А., Хименес-Хасинто В., Вега-Альварадо Л. , Дель Мораль-Чавес В., Эрнандес-Альварес А., Моретт Э., Кольядо-Видес Дж. 2013. RegulonDB v8.0: наборы данных omics, эволюционное сохранение, нормативные фразы, перекрестная проверка золотых стандартов и многое другое. Нуклеиновые Кислоты Res. 41:D203–D213 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

12. Maynard ND, Birch EW, Sanghvi JC, Chen L, Gutschow MV, Covert MW. 2010. Прямой генетический скрининг и динамический анализ зависимостей от хозяина фага лямбда выявляют обширную сеть взаимодействия и новую противовирусную стратегию. Генетика PLoS. 6:e1001017. 10.1371/journal.pgen.1001017 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

13. Zhang R, Ou HY, Zhang CT. 2004. DEG: база данных основных генов. Нуклеиновые Кислоты Res. 32: D271–D272 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

14. Вучти С. 2004. Эволюция и топология сети взаимодействия белков дрожжей. Геном Res. 14:1310–1314 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

15. Häuser R, Blasche S, Dokland T, Haggard-Ljungquist E, von Brunn A, Salas M, Casjens S, Molineux I, Uetz P . 2012. Белок-белковые взаимодействия бактериофагов. Доп. Вирус рез. 83:219–298 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

16. Баба Т., Ара Т., Хасегава М., Такай Ю., Окумура Ю., Баба М., Даценко К.А., Томита М., Ваннер Б.Л., Мори Х. . 2006. Конструирование внутрикаркасных мутантов Escherichia coli K-12 с нокаутом одного гена: коллекция Keio. Мол. Сист. биол. 2:2006 0008 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

17. Дайер М.Д., Мурали Т.М., Собрал Б.В. 2008. Ландшафт человеческих белков, взаимодействующих с вирусами и другими патогенами. PLoS Патог. 4:е32. 10.1371/journal.ppat.0040032 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

18. Jeong H, Mason SP, Barabasi AL, Oltvai ZN. 2001. Летальность и центральность в белковых сетях. Природа 411:41–42 [PubMed] [Google Scholar]

19. Casjens S. 2003. Профаги и бактериальная геномика: что мы уже узнали? Мол. микробиол. 49:277–300 [PubMed] [Google Scholar]

20. Кимрон У., Маринчева Б., Табор С., Ричардсон С.С. 2006. Полногеномный скрининг генов Escherichia coli, влияющих на рост бактериофага Т7. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103:19039–19044 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

21. Wuchty S, Siwo G, Ferdig MT. 2010. Вирусная организация белков человека. PLoS один 5:e11796. 10.1371/journal.pone.0011796 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

22. Wuchty S. 2011. Компьютерное прогнозирование взаимодействия белков хозяина и паразита между Plasmodium falciparum и Homo sapiens. PLoS один 6:е26960. 10.1371/journal.pone.0026960 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

23. Wuchty S, Siwo GH, Ferdig MT. 2011. Общие молекулярные стратегии малярийного паразита Plasmodium falciparum и человеческого вируса ВИЧ-1. Мол. Клетка. протеомика 10:M111 009035. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

24. Calderwood MA, Venkatesan K, Xing L, Chase MR, Vazquez A, Holthaus AM, Ewence AE, Li N, Hirozane-Kishikawa T, Хилл Д.Э., Видал М., Кифф Э., Йоханнсен Э. 2007. Карты взаимодействия белков вируса Эпштейна-Барр и вируса человека. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104:7606–7611 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

25. Остерхаут Р.Е., Фигероа И.А., Кислинг Д.Д., Аркин А.П. 2007. Общий анализ ответа хозяина на индукцию латентного бактериофага. БМС микробиол. 7:82. 10.1186/1471-2180-7-82 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

26. Kobiler O, Oppenheim AB, Herman C. 2004. Рекрутирование АТФ-зависимых протеаз хозяина бактериофагом лямбда. Дж. Структура. биол. 146:72–78 [PubMed] [Google Scholar]

27. Kedzierska B, Szambowska A, Herman-Antosiewicz A, Lee DJ, Busby SJ, Wegrzyn G, Thomas MS. 2007. С-концевой домен альфа-субъединицы РНК-полимеразы Escherichia coli играет роль в CI-зависимой активации промотора pM бактериофага лямбда. Нуклеиновые Кислоты Res. 35:2311–2320 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

28. Ли М., Мойл Х., Сасскинд М.М. 1994. Мишень функции активации транскрипции белка cI фага лямбда. Наука 263:75–77 [PubMed] [Google Scholar]

29. Nickels BE, Roberts CW, Sun H, Roberts JW, Hochschild A. 2002. Субъединица σ ⁷⁰ РНК-полимеразы контактирует с λQ. антитерминатор во время ранней элонгации. Мол. Клетка 10:611–622 [PubMed] [Google Scholar]

30. Кихара А., Акияма Ю., Ито К. 2001. Пересмотр контроля лизогенизации бактериофага лямбда. Идентификация и характеристика нового компонента-хозяина, HfID. Дж. Биол. хим. 276:13695–13700 [PubMed] [Google Scholar]

31. Kobiler O, Koby S, Teff D, Court D, Oppenheim AB. 2002. Активатор транскрипции фага лямбда CII несет С-концевой домен, сигнализирующий о быстром протеолизе. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99:14964–14969 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

32. Shotland Y, Shifrin A, Ziv T, Teff D, Koby S, Kobiler O, Oppenheim AB. 2000. Протеолиз бактериофага лямбда CII Escherichia coli FtsH (HflB). Дж. Бактериол. 182:3111–3116 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

33. Kedzierska B, Lee DJ, Wegrzyn G, Busby SJ, Thomas MS. 2004. Роль альфа-субъединиц РНК-полимеразы в CII-зависимой активации промотора pE бактериофага лямбда: идентификация важных остатков и позиционирование альфа-С-концевых доменов. Нуклеиновые Кислоты Res. 32:834–841 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

34. Marr MT, Datwyler SA, Meares CF, Roberts JW. 2001. Реструктуризация холоферментного элонгационного комплекса РНК-полимеразы белками Q. лямбдоидного фага. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98:8972–8978 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

35. Kornitzer D, Altuvia S, Oppenheim AB. 1991. Активность регулятора CIII лямбдоидных бактериофагов находится в белковом домене из 24 аминокислот. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88:5217–5221 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

36. Friedman DI, Court DL. 2001. Бактериофаг лямбда: жив и здоров и все еще делает свое дело. Курс. мнение микробиол. 4:201–207 [PubMed] [Google Scholar]

37. Gottesman S, Gottesman M, Shaw JE, Pearson ML. 1981. Деградация белка в Escherichia coli: мутация lon и стабильность белков бактериофага лямбда N и cII. Клетка 24:225–233 [PubMed] [Google Scholar]

38. Roberts CW, Roberts JW. 1996. Основание-специфическое распознавание нематричной цепи промотора ДНК РНК-полимеразой Escherichia coli. Клетка 86:495–501 [PubMed] [Google Scholar]

39. Roberts JW, Yarnell W, Bartlett E, Guo J, Marr M, Ko DC, Sun H, Roberts CW. 1998. Антитерминация белком Q бактериофага лямбда. Колд-Спринг-Харбор Симп. Квант. биол. 63:319–325 [PubMed] [Google Scholar]

40. Анг Д., Кеппел Ф., Кляйн Г., Ричардсон А., Георгопулос К. 2000. Генетический анализ кошаперонинов, кодируемых бактериофагами. Анну. Преподобный Жене. 34:439–456 [PubMed] [Google Scholar]

41. Georgopoulos CP, Hendrix RW, Casjens SR, Kaiser AD. 1973. Участие хозяина в сборке головы бактериофага лямбда. Дж. Мол. биол. 76:45–60 [PubMed] [Google Scholar]

42. Муриальдо Х. 1979. Ранние промежуточные соединения в сборке переднего отдела бактериофага лямбда. Вирусология 96:341–367 [PubMed] [Google Scholar]

43. Бухвальд М., Симинович Л. 1969. Продукция блокирующего сыворотку материала мутантами левого плеча лямбда-хромосомы. Вирусология 38:1–7 [PubMed] [Google Scholar]

44. Clement JM, Lepouce E, Marchal C, Hofnung M. 1983. Генетическое исследование мембранного белка: изменения последовательности ДНК из-за 17 точечных мутаций lamB , влияющих на адсорбцию фага лямбда. ЭМБО Дж. 2:77–80 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

45. Mount DW, Harris AW, Fuerst CR, Siminovitch L. 1968 год. Мутации бактериофага лямбда, влияющие на морфогенез частиц. Вирусология 35:134–149 [PubMed] [Google Scholar]

46. Ван Дж., Хофнунг М., Чарбит А. 2000. С-концевая часть белка хвостового отростка бактериофага лямбда отвечает за связывание с LamB, его рецептором на поверхности Escherichia coli K-12. Дж. Бактериол. 182:508–512 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

47. Werts C, Michel V, Hofnung M, Charbit A. 1994. Адсорбция бактериофага лямбда на белке LamB Escherichia coli K-12: точечные мутации в гене J. lambda, ответственные за расширенный круг хозяев. Дж. Бактериол. 176:941–947 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

48. Hendrix RW, Duda RL. 1992. Бактериофаг лямбда PaPa: не мать всех фагов лямбда. Наука 258:1145–1148 [PubMed] [Google Scholar]

49. Leffers GG, Jr., Gottesman S. 1998. Разложение Lambda Xis in vivo под действием Lon и FtsH. Дж. Бактериол. 180:1573–1577 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

50. Ball CA, Johnson RC. 1991. Для эффективного удаления фага лямбда из хромосомы Escherichia coli требуется белок Fis. Дж. Бактериол. 173:4027–4031 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

51. Cho EH, Gumport RI, Gardner JF. 2002. Взаимодействия между интегразой и эксцизионазой в эксцизивном нуклеопротеиновом комплексе фага лямбда. Дж. Бактериол. 184:5200–5203 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

52. Esposito D, Gerard GF. 2003. Белок Escherichia coli Fis стимулирует интегративную рекомбинацию бактериофага лямбда in vitro. Дж. Бактериол. 185:3076–3080 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

53. Кэмпбелл А., дель-Кампильо-Кэмпбелл А., Гинзберг М.Л. 2002. Специфичность распознавания ДНК фаговыми интегразами. Ген 300:13–18 [PubMed] [Google Scholar]

54. Crisona NJ, Weinberg RL, Peter BJ, Sumners DW, Cozzarelli NR. 1999. Топологический механизм фаговой лямбда-интегразы. Дж. Мол. биол. 289:747–775 [PubMed] [Google Scholar]

55. Kulkarni SK, Stahl FW. 1989. Взаимодействие между геном sbcC Escherichia coli и геном gam фага лямбда. Генетика 123:249–253 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

56. Marsic N, Roje S, Stojiljkovic I, Salaj-Smic E, Trgovcevic Z. 1993. Исследования in vivo взаимодействия фермента RecBCD и белка лямбда-Gam. Дж. Бактериол. 175:4738–4743 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

57. Maxwell KL, Reed P, Zhang RG, Beasley S, Walmsley AR, Curtis FA, Joachimiak A, Edwards AM, Sharples GJ. 2005. Функциональное сходство между фагом лямбда Orf и Escherichia coli RecFOR в инициации генетического обмена. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102:11260–11265 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

58. Лоенен В.А., Мюррей Н.Е. 1986 год. Усиление модификации белком облегчения рестрикции (Ral) бактериофага лямбда. Дж. Мол. биол. 190:11–22 [PubMed] [Google Scholar]

59. Либерек К., Георгопулос К., Жилич М. 1988 год. Роль белков теплового шока DnaK и DnaJ Escherichia coli в инициации репликации ДНК бактериофага лямбда. проц. Натл. акад. науч. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 85:6632–6636 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

60. Szambowska A, Pierechod M, Wegrzyn G, Glinkowska M. 2011. Соединение механизмов транскрипции и репликации при инициации репликации лямбда-ДНК: свидетельство прямого взаимодействия РНК-полимеразы Escherichia coli и белка лямбда-О. Нуклеиновые Кислоты Res. 39: 168–177 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

61. Датта И., Баник-Маити С., Адхикари Л., Сау С., Дас Н., Мандал Н.С. 2005. Мутация, которая делает Escherichia coli устойчивой к летальности хозяина, опосредованной геном лямбда-P, локализована в гене-инициаторе ДНК dnaA бактерии. Дж. Биохим. Мол. биол. 38:89–96 [PubMed] [Google Scholar]

62. Мэллори Дж. Б., Альфано С., Макмакен Р. 1990. Взаимодействия вируса-хозяина в инициации репликации ДНК бактериофага лямбда. Рекрутирование геликазы DnaB Escherichia coli репликационным белком лямбда-P. Дж. Биол. хим. 265:13297–13307 [PubMed] [Google Scholar]

63. Wegrzyn A, Taylor K, Wegrzyn G. 1996. Функция гена-шаперона cbpA компенсирует dnaJ в репликации лямбда-плазмиды во время аминокислотного голодания Escherichia coli. Дж. Бактериол. 178:5847–5849 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

64. Wegrzyn A, Wegrzyn G. 2001. Наследование репликационного комплекса: уникальное или обычное явление в контроле репликации ДНК? Арка микробиол. 175:86–93 [PubMed] [Google Scholar]

65. Потрикус К., Баранска С., Вегжин А., Вегжин Г. 2002. Состав комплекса наследуемой репликации лямбда-плазмиды. Биохим. Дж. 364:857–862 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

66. Wegrzyn G, Wegrzyn A. 2002. Стрессовые реакции и репликация плазмид в бактериальных клетках. микроб. Сотовый факт 1:2. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

67. Керриен С., Аранда Б., Бреуза Л., Бридж А., Броакс-Картер Ф., Чен С., Дюсбери М., Дюмуссо М., Фейерманн М., Хинц Ю., Джандраситс С. , Хименес Р.С., Хадаке Дж., Махадеван У., Массон П., Педруцци И., Пфайффенбергер Э., Поррас П., Рагунатх А., Рохерт Б., Орчард С., Хермякоб Х. 2012. База данных молекулярного взаимодействия IntAct в 2012 г. Nucleic Acids Res. 40:D841–D846 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

RCSB PDB — 6G0X: TAILSPIKE PROTEIN OF E. COLI BACTERIOPHAGE HK620 IN COMPLEX WITH PENTASACCHARIDE

• Structure Summary
• 3D View
• Annotations
• Experiment
• Sequence
• Genome
• Versions

PreviousNext

Содержание макромолекул

• Общий вес структуры: 65,91 кДа
• Количество атомов: 5629
• Количество смоделированных остатков: 599&nbsp
• Deposited Residue Count: 599&nbsp
• Unique protein chains: 1

TAILSPIKE PROTEIN OF E.

---

wwPDB Validation &nbsp &nbsp 3D Report&nbspFull Report




Это версия 2.0 записи. См. полную историю.

Кунстманн, С., Гольке, У., Брокер, Н.К., Роске, Ю., Хайнеманн, У., Сантер, М., Барбирц, С.

(2018) J Am Chem Soc&nbsp 07-90 1490 1690 1640 10455

• PubMed :&nbsp30044908&nbspSearch on PubMed
• DOI:&nbsp 10.1021/jacs.8b03719


• PubMed Abstract:&nbsp
  

The principles of protein-glycan binding are still not well understood on a molecular уровень. Попытки связать аффинность и специфичность узнавания гликанов со структурой страдают от общего отсутствия модельных систем для экспериментальных исследований и сложности описания влияния растворителя…

Принципы связывания белков с гликанами до сих пор недостаточно изучены на молекулярном уровне. Попытки связать аффинность и специфичность узнавания гликанов со структурой страдают от общего отсутствия модельных систем для экспериментальных исследований и сложности описания влияния растворителя. Мы экспериментально и с помощью вычислений рассмотрели энергетический вклад растворителя в образование белково-гликанового комплекса в белке хвостового шипа (TSP) бактериофага E. coli HK620. HK620TSP представляет собой нативный тример с молекулярной массой 230 кДа, состоящий из правозакрученных параллельных бета-спиралей, которые обеспечивают протяженные жесткие сайты связывания полисахаридов О-антигена поверхности бактериальной клетки. Набор высокоаффинных мутантов связывает гекса- или пентасахаридные фрагменты О-антигена с очень сходной аффинностью, даже несмотря на то, что гексасахариды вводят дополнительную глюкозную ветвь в закрытую полость на поверхности белка. Для разных мутантов были обнаружены удивительно разные термодинамические сигнатуры связывания; однако анализ кристаллической структуры показал, что при образовании комплекса не произошло никаких серьезных изменений топологии олигосахаридов или белков. Это указывало на эффект растворителя. Моделирование молекулярной динамики с использованием подхода, основанного на подвижности, выявило расширенную сеть позиций растворителя, распределенных по всему сайту связывания олигосахаридов. Однако расчеты свободной энергии показали, что наиболее заметное влияние на термодинамическую характеристику оказывает небольшая сеть воды внутри полости, связывающей глюкозу. Энергия, необходимая для вытеснения воды из кармана, связывающего глюкозу, зависела от аминокислоты на входе, что согласуется с различной степенью энтальпийно-энтропийной компенсации, обнаруженной при введении глюкозы в карман у разных мутантов. Ранее исследования низкомолекулярных препаратов показали, что несколько активных молекул воды могут контролировать образование белковых комплексов. Связывание олигосахаридов HK620TSP показывает, что аналогичные фундаментальные принципы также применимы к гликанам, где небольшое количество молекул воды может доминировать в термодинамической сигнатуре в расширенном сайте связывания.

---

Ссылки по теме:&nbsp

---

Организационная принадлежность :&nbsp

Physikalische Biochemie, Universität Potsdam, Karl-Liebknecht-Str. 24-25, 14476 Потсдам, Германия.






Макромолекулы

Найдите похожие белки по: 

(по порогу идентичности)  | Трехмерная структура

Идентификатор объекта: 1
Молекула	Цепи	Sequence Length	Organism	Details	Image
Tail spike protein	A	599	Enterobacteria phage HK620	Mutation(s) : 0&nbsp Gene Names:&nbsp 9
UniProt
Найти белки для&nbspQ9AYY6&nbsp (энтеробактерии фага HK0299 ) AYY6&nbsp Перейти к UniProtKB: &nbspQ9AYY6
Группы объектов &nbsp
Sequence Clusters	30% Identity50% Identity70% Identity90% Identity95% Identity100% Identity
UniProt Group	Q9AYY6
Protein Feature View Expand
Эталонная последовательность

Oligosaccharides

Help

Entity ID: 2
Molecule	Chains	Chain Length	2D Diagram	Glycosylation	3D Interactions
alpha-L- рамнопираноза-(1-6)-альфа-D-глюкопираноза-(1-4)-[2-ацетамидо-2-дезокси-бета-D-глюкопираноза-(1-3)]альфа-D-галактопираноза-(1- 3)-2-ацетамидо-2-дезокси-бета-D-глюкопираноза	B	6		N/A	Oligosaccharides Interaction
Glycosylation Resources
GlyTouCan: &nbspG44015RX GlyCosmos: &nbspG44015RX

Small Molecules

4 C [Auther At.

Лиганды&nbsp3 Уникальные
ID	Цепи	Название/Формула/ИнЧИ Ключ	2D Диаграмма	3D взаимодействия
TRS Запрос на TRS Скачать Идеальные координаты CCD и NBSP	.10274.1024.1024.10124.10124.10124.1024.1024.1024.1024.1024.1024.1024.1024.1024.1024.1024. C 4 H 12 N O 3 LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-O		Ligand Interaction
FMT Query on FMT Download Ideal Coordinates CCD File&nbsp	D [идентификация A], E [идентификация A], F [идентификация A], G [идентификация A], H [идентификация A]	МУРАВЬИНАЯ КИСЛОТА CH 2 O 2 BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N		Ligand Interaction
NA Query on NA Download Ideal Coordinates CCD File&nbsp	I [auth A], J [auth A], K [ auth A]	ИОН НАТРИЯ Na FKNQFGJONOIPTF-UHFFFAOYSA-N		Ligand Interaction

Experimental Data & Validation

Experimental Data

Unit Cell :

4 γ = 120277 C = 174,871. 0169

Length ( Å )	Angle ( ˚ )
a = 74,32	α = 90
B = 74,32	β =
C = 174,871	γ = 120274 C = 174,871	γ = 120277 C = 174,871

Software Name	Purpose
REFMAC	refinement
XSCALE	data reduction
Aimless	data scaling
PHASER	phasing




Посмотреть более подробные экспериментальные данные

История поступления&nbsp& Информация о финансировании

Данные о осаждении

• Released Date:&nbsp 2018-04-04&nbsp
Deposition Author(s):&nbsp Gohlke, U., Broeker, N.K., Seckler, R., Barbirz, S.

---

Funding Organization	Расположение	Грант №
Немецкий исследовательский фонд	Германия	BA 4046/1-2

35.0172

Version 1.0: 2018-04-04
Type: Initial release

• Version 1.